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Institut de Chimie des Substances Naturelles

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Description technique de la plate-forme

Spectromètre IR : 950 MHz [Liquide]

• Spectromètre 950 MHz Bruker Avance III équipé d'une cryosonde TCI (1H,13C,15N,2H) 5mm, gradients-z (S/B = 9307) travaillant de 0°C à 80 °C, compatible tubes ovale (échantillons salins)

• Equipement haute pression « deadalus inc» (disponible à partir de 2014), avec 1 tube en céramique (1?2.5kbar, 0?100°C)

Expériences RMN disponibles :

RMN rapide (BEST, SOFAST, ...), Méthodes d’échantillonage non linéaire ou de projection, Expérience triple résonance 3D, 4D pour protéines et acides nucléiques, Relaxation et Dispersion de Relaxation, Couplages Dipolaires Résiduels, RMN des méthyls, Interactions Protéines ligands, DOSY.

Domaines principaux d'application :

Structure, dynamique et interactions des macromolécules biologiques ; petites molécules en faible quantité.

Autres équipements RMN à l'ICSN

800 MHz Bruker Avance III Liquide

Sonde liquide:
Cryo TCI (1H, 13C, 15N, 2H), 5mm, z-gradients

700 MHz Bruker Avance II Liquide / Solide

Sondes liquides:
TXI (1H, 13C, 15N, 2H), 5mm, (x,y,z)-gradients
Sondes solides:
MAS (1H, 13C, 15N), 4 mm
Sonde statique (1H, 13C, 31P,15N)
CPMAS (1H, 13C, 31P), XX mm, + lock

600 MHz (Bruker-1) Bruker Avance I Liquide

Sonde liquide:
Cryo TCI (1H, 13C, 15N, 2H), 5mm, z-gradients

Passeur d’échantillon SampleJet (avec régulation de température)

600 MHz (Bruker-2) Bruker Avance I Liquide

Sonde liquide:
Cryo TXI (1H, 13C, 15N, 2H), 5mm, z-gradients

De plus, un service de RMN est à la disposition des chimistes, avec un 600MHz, deux 500MHz et deux 300MHz.

A propos de l' ICSN

Les spectromètres de RMN sont gérés par l’équipe ‘Laboratoire de Biologie et Chimie Structurales’ de l’Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), sur le campus CNRS de Gif-sur-Yvette. La recherche sur le campus est essentiellement centrée sur la chimie et la biologie, avec une forte composante de biologie structurale dans un contexte biologie et santé. Le campus de Gif est intégré dans le « grand campus Paris-Saclay » (http://www.campus-paris-saclay.fr/en/The-FCS), qui regroupe plus de 10000 chercheurs de tous les horizons scientifiques, et une forte communauté de chercheurs en biologie structurale (Gif-sur-Yvette, Université Paris 11, le CEA à Saclay et le synchrotron SOLEIL).

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Quelques publications récentes :

  • CAVALIERE, P., SIZUN, C., LEVI-ACOBAS, F., NOWAKOWSKI, M., MONTEIL, V., BONTEMS, F., BELLALOU, J., MAYER, C., AND NOREL, F. (2015) Binding interface between the Salmonella sigma(S)/RpoS subunit of RNA polymerase and Crl: hints from bacterial species lacking crl. Sci Rep 5, 13564
  • FRANCES, O., FATEMI, F., POMPON, D., GUITTET, E., SIZUN, C., PEREZ, J., LESCOP, E., AND TRUAN, G. (2015) A well-balanced preexisting equilibrium governs electron flux efficiency of a multidomain diflavin reductase. Biophys J 108, 1527-1536
  • DUMEZ, J. N., MILANI, J., VUICHOUD, B., BORNET, A., LALANDE-MARTIN, J., TEA, I., YON, M., MAUCOURT, M., DEBORDE, C., MOING, A., FRYDMAN, L., BODENHAUSEN, G., JANNIN, S., AND GIRAUDEAU, P. (2015) Hyperpolarized NMR of plant and cancer cell extracts at natural abundance. Analyst 140, 5860-5863
  • PRADINES, B., GALLARD, J. F., IORGA, B. I., GUEUTIN, C., PONCHEL, G., LOISEAU, P. M., AND BOUCHEMAL, K. (2015) The unexpected increase of clotrimazole apparent solubility using randomly methylated beta-cyclodextrin. J Mol Recognit 28, 96-102
  • GUENNEC, A. L., GIRAUDEAU, P., CALDARELLI, S., AND DUMEZ, J. N. (2015) Ultrafast double-quantum NMR spectroscopy. Chem Commun (Camb) 51, 354-357
  • OUIZOUGUN-OUBARI, M., PEREIRA, N., TARUS, B., GALLOUX, M., LASSOUED, S., FIX, J., TORTORICI, M. A., HOOS, S., BARON, B., ENGLAND, P., DESMAELE, D., COUVREUR, P., BONTEMS, F., REY, F. A., ELEOUET, J. F., SIZUN, C., SLAMA-SCHWOK, A., AND DUQUERROY, S. (2015) A druggable pocket at the nucleocapsid/phosphoprotein interaction site of the human respiratory syncytial virus. J Virol
  • ANDRE, M., PIOTTO, M., CALDARELLI, S., and DUMEZ, J. N. (2015) Ultrafast high-resolution magic-angle-spinning NMR spectroscopy. Analyst 140, 3942-3946
  • ABET, V., EVANS, R., GUIBBAL, F., CALDARELLI, S., AND RODRIGUEZ, R. (2014) Modular construction of dynamic nucleodendrimers. Angew Chem Int Ed Engl 53, 4862-4866
  • ANDRE, M., DUMEZ, J. N., REZIG, L., SHINTU, L., PIOTTO, M., AND CALDARELLI, S. (2014) Complete protocol for slow-spinning high-resolution magic-angle spinning NMR analysis of fragile tissues. Anal Chem 86, 10749-10754
  • APEL, C., GENY, C., DUMONTET, V., BIRLIRAKIS, N., ROUSSI, F., PHAM, V. C., DOAN THI MAI, H., NGUYEN, V. H., CHAU, V. M., AND LITAUDON, M. (2014) Endiandric acid analogues from Beilschmiedia ferruginea as dual inhibitors of Bcl-xL/Bak and Mcl-1/Bid interactions. J Nat Prod 77, 1430-1437
  • ASSRIR, N., RICHEZ, C., DURAND, P., GUITTET, E., BADET, B., LESCOP, E., AND BADET-DENISOT, M. A. (2014) Mapping the UDP-N-acetylglucosamine regulatory site of human glucosamine-6P synthase by saturation-transfer difference NMR and site-directed mutagenesis. Biochimie 97, 39-48
  • AZMI, M. N., GENY, C., LEVERRIER, A., LITAUDON, M., DUMONTET, V., BIRLIRAKIS, N., GUERITTE, F., LEONG, K. H., HALIM, S. N., MOHAMAD, K., AND AWANG, K. (2014) Kingianic acids A-G, Endiandric acid analogues from Endiandra kingiana. Molecules 19, 1732-1747
  • DESRAT, S., REMEUR, C., GENY, C., RIVIERE, G., COLAS, C., DUMONTET, V., BIRLIRAKIS, N., IORGA, B. I., AND ROUSSI, F. (2014) From meiogynin A to the synthesis of dual inhibitors of Bcl-xL and Mcl-1 anti-apoptotic proteins. Chem Commun (Camb) 50, 8593-8596
  • MEOLA, A., DEVILLE, C., JEFFERS, S. A., GUARDADO-CALVO, P., VASILIAUSKAITE, I., SIZUN, C., GIRARD-BLANC, C., MALOSSE, C., VAN HEIJENOORT, C., CHAMOT-ROOKE, J., KREY, T., GUITTET, E., PETRES, S., REY, F. A., AND BONTEMS, F. (2014) Robust and low cost uniform (15)N-labeling of proteins expressed in Drosophila S2 cells and Spodoptera frugiperda Sf9 cells for NMR applications. J Struct Biol 188, 71-78
  • PLANCHARD, N., POINT, E., DAHMANE, T., GIUSTI, F., RENAULT, M., LE BON, C., DURAND, G., MILON, A., GUITTET, E., ZOONENS, M., POPOT, J. L., AND CATOIRE, L. J. (2014) The use of amphipols for solution NMR studies of membrane proteins: advantages and constraints as compared to other solubilizing media. J Membr Biol 247, 827-842
  • PRADINES, B., GALLARD, J. F., IORGA, B. I., GUEUTIN, C., LOISEAU, P. M., PONCHEL, G., AND BOUCHEMAL, K. (2014) Investigation of the complexation of albendazole with cyclodextrins for the design of new antiparasitic formulations. Carbohydr Res 398, 50-55
  • ZARGARIAN, L., TISNE, C., BARRAUD, P., XU, X., MORELLET, N., RENE, B., MELY, Y., FOSSE, P., AND MAUFFRET, O. (2014) dynamics of linker residues modulate the nucleic acid binding properties of the hiv-1 nucleocapsid protein zinc fingers. PLoS One 16;9(7).
  • REDDY M., BALLESTEROS-GARRIDO R., LACOUR J., CALDARELLI S. Determination of labile chiral supramolecular ion pairs by chromatographic NMR spectroscopy. Angew. Chem. Int. Ed., (2013), 52(11),  3255-3258.
  • RENAULT L., DEVILLE C., VAN HEIJENOORT C., Structural features and interfacial properties of WH2, ?-thymosin domains and other intrinsically disordered domains in the regulation of actin cytoskeleton dynamics Cytoskeleton (Hoboken). (2013), 70(11), 686-705.
  • VINCENT B., MORELLET N., FATEMI F., AIGRAIN L., TRUAN G., GUITTET E., LESCOP E. The closed and compact domain organization of the 70-kDa human cytochrome P450 reductase in Its oxidized state as revealed by NMR. J. Mol. Biol., 2012, 420(4-5), 296-309.
  • DIDRY D., CANTRELLE F.X., HUSSON C., ROBLIN P., MOORTHY A.M.E., PEREZ J., LE CLAINCHE C., HERTZOG M., GUITTET E., CARLIER M.F., VAN HEIJENOORT C., RENAULT L. How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly. EMBO J., (2012), 31(4), 1000-1013.